与风机盘管连接的冷、热水管的进水管上，可安装Y型水过滤器，以清除管道中的机械杂质和污泥，以免风机盘管堵塞。
风机盘管与冷、热水管的连接应按”下送上回”的形式安装，以进步空气处理的热交换性能。
卧式明装风机盘管安装进出水管时，风机盘管，可在地面上将进出水管接出机外，吊装后再与管道连接，也可在吊装后，风机盘管电动阀，将面板和凝聚水盘取下，再进行连接。立式明装风机盘管安装进出水管时，可将机组风口、面板取下进行安装。
风机盘管安装位置必须正确，螺栓配置垫片。风机盘管风机盘管与风管连接处应用橡胶板连接，空调风机盘管，保证严密不漏。
暗装卧式的风机盘管应有支、吊架固定，为便于拆卸，风机盘管温控器，维修和更换风机盘管，土建顶棚应设置比暗装风机盘管四周大250mm的活动顶棚，活动顶棚不得有龙骨挡位。
安装时，需留意机组与供回水管的保温质量，防止产生凝聚水，机组凝聚水盘应排水通畅，机组的排水应有3%的坡度流向指定位置。
风机盘管做为集中空调的末端设备，其质量的好坏决定了室内的风机盘管风量一定，供水温度一定，供水量变化时，制冷量随卧式暗装风机盘管供水量的变化而变化，根据部分风机盘管产品性能统计，当供水温度为7℃，供水量减少到80%时，制冷量为原来的92%左右，说明当供水量变化时对制冷量的影响较为缓慢。空调效果。性能主要是送冷（热）量的保障、送风量的保障，噪音的数值比、冷凝水不泄漏及电器、钣金件设计的合理性等等。
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