商户和消费者的资金在财付通层面划转时，受到央行2013年《支付机构客户备付金存管办法》的严格监管；但代理商的“二级账户”并无相应监管，存在代理商挪用商户资金的风险隐患。
“这件事对微信支付有一定影响。”前述团队负责人说，当前微信推广二维码支付时，已彻底取消“二清账户”，直接给所有商户开通支付接口，这样虽然增大运营成本，但满足了合规要求。黄新山亦证实了这一细节，“资金流直接到财付通，不通过我们公司。”
不少业内人士认为，支付宝服务窗，推进节奏不一也跟支付宝、微信各自投入力度有关。譬如，支付宝动用“真金白银”补贴消费者，微信未有同等让利；某股份行广州分行电子银行部负责人甚至认为，财付通并未积极向银行开放端口，微信支付代理，影响到微信支付的客户覆盖面，“去年我们跟腾讯谈接入，总行副行长出面，连财付通的部门负责人都没见到”。
三 收益分析：
1微信支付合作商线下收单费率利润分析： 分润0.6%结算
举例：福州连锁清口清汤面年营业额4.5亿，每周二微信日，支付宝服务窗加盟，流水占总营业额的1/7以上，一年分润45000万*1/7*0.006=38.57万
2微信支付到账时间365天实时秒到，商家刷码秒到账，不分节假日，到账时间颠覆传统pos行业
3无缝对接所有收银系统，商家更便捷，推广更容易，对收银系统商可实现二次创收
4服务，支付，本公司卖的就是服务，以及技术支持，让您发展市场无后顾之忧
5 风险：(1)无库存积压风险（2）资金秒到商家更放心（3）相对pos机无追偿调单困难
四 商户商家收入、成本分析：
1微信支付与传统POS机：费率对比。（统一装0.6费率）
酒店 餐饮 娱乐行业，传统POS收款费率1.25％， 普通行业费率0.78，民生0.38，微信支付收款费率0.6％，
2 微信公众号线上推广吸引客户，线下吸粉带动线上推广增加商家盈利
微信公众号营销手段：优惠券，红包裂变，摇一摇，会员管理
（1）一个饭店一天增加10个客户，一个客户消费200元，按30％利润计算：
10人*200元*30％=600元*30天=18000元/月，一年就是21.6万元；
（2）一个便利店一天增加10个客户，一个客户消费50元，按30％利润计算：
10人*50元*30％=150元*30天=4500元/月，一年就是5.4万元；
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