年度汇算清缴时针对企业所得税的，你公司的企业所得税在哪个税务局缴纳汇算同样就在哪个税务局申报，不是说哪个税务局要做或者哪个税务局不做。
年度汇算清缴主要是对整个年度的企业所得税进行清算，一般情况下关注以下问题：
1、会计和税收差异。包括税收上的限额扣除(如业务招待费)，海淀汇算清缴，计提的一些费用(如坏账准备)，符合税收规定但达不到会计规定的一些收入，汇算清缴怎么收费，固定资产年限等。
2、税收上有特殊规定的一些项目，比如不征税收入的管理是否到达税收上的要求，比如资产损失的确认是否到税务机关进行备案等等。
3、应该确认收入而未确认的收入，例如一些预收账款或者往来款项。
4、费用扣除的一些规范问题。比如票据是否合规等。
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审计是工商年检用，年检通知会注明要求出审计报告企业的条件;税审是税务局要求企业出具税务鉴定报告，开汇算清缴会的时候会说明出税务鉴定报告企业的条件;汇算清缴就是企业所得税年报，汇算清缴收费，五月底前报送数据，汇算清缴，清算企业全年有无调增调减事项，清缴所得税款。
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财产损失要申报
根据《国家税务总局关于发布企业资产损失所得税税前扣除管理办法的公告》(国家税务总局公告〔2011〕第25号)第四条规定，企业实际资产损失，应当在其实际发生且会计上已作损失处理的年度申报扣除;法定资产损失，应当在企业向主管税务机关提供证据资料证明该项资产已符合法定资产损失确认条件，且会计上已作损失处理的年度申报扣除。该《公告》第五条还规定，企业发生的资产损失，应按规定的程序和要求向主管税务机关申报后方能在税前扣除。未经申报的损失，不得在税前扣除。
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