主动纠正申报错误
纳税人于年度终了后45日内办理了年度纳税申报后，亏损审计，如果发现申报出现了错误，根据《企业所得税汇算清缴管理办法》等法律的相关规定：纳税人办理年度所得税申报后，在汇缴期内税务机关检查之前自行检查发现申报不实的，可以填报《企业所得税自查申报表》向税务机关主动申报纠正错误，税务机关据此调整其全年应纳所得税额及应补、应退税额。
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税务机关受理申请，并审核所报送材料
A、主管税务机关接到纳税人或扣缴义务人报送的纳税申报表或代扣代缴、代收代缴税款报告表后，经审核其名称、电话、地址、银行帐号等基本资料后，若发现应由主管税务机关管理的内容有变化的，将要求纳税人提供变更依据;如变更内容属其他部门管理范围的，则将敦促纳税人到相关部门办理变更手续，并将变更依据复印件移交主管税务机关。
B、主管税务机关对申报内容进行审核，主要审核税目、税率和计税依据填写是否完整、正确，税额计算是否准确，附送资料是否齐全、是否符合逻辑关系、是否进行纳税调整等。审核中如发现纳税人的申报有计算错误或有漏项，将及时通知纳税人进行调整、补充、修改或限期重新申报。纳税人应按税务机关的通知作出相应的修正。
C、主管税务机关经审核确认无误后，确定企业当年度应纳所得税额及应当补缴的企业所得税款，或者对多缴的企业所得税款加以退还或抵顶下年度企业所得税。
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电子申报要熟练
在系统安装后首次输入企业信息的时候要仔细填写企业的基础信息，包括企业的行业、经济性质、核算方式即就地缴纳还是汇总缴纳等，这些基础信息都要填写，而且要和税务登记信息即税务局的CTAIS中登记信息一致，企业所得税汇算清缴审计，才能申报成功。企业在录入数据的时候，每张表格包括主表、附表和财务报表都要填写，没有数据的就填零。特别是财务报表的期初和期末数都要填，而且资产负债表的期初数不能为零。有些企业的资产负债表的期初数都填零，结果不能打包通过，审计，新开户的企业资产负债表的期初数就填写企业开业时的经济状态，记住不能零。在申报表的主表中，如果企业是亏损的，在应纳税所得额这一栏不能填负数，应该填0。
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