工程结算审计质量控制的原则，概括地讲应当为实事求是的原则，具体可以包括：依法审计原则、全面审计原则、突出重点原则和成本效益原则。
1.依法审计原则。“依法审计”是包括工程结算审计业务工作在内的各项审计工作固有的基本原则，也是最高原则，同时也是保证审计质量的关键。
坚持“依法审计”，不仅要依法开展审计工作，而且要严格履行审计监督职责，充分揭露问题，还要实事求是地认定和处理问题。
2.全面审计原则。“全面审计”是审计工作必须长期坚持的指导方针，也是把握好工程结算审计业务工作全局、提高审计质量的根本要求。坚持“全面审计”原则，需要科学制定审计方案，从宏观上把握审计对象的总体情况和经济运行的内在规律，审计价格，明确审计目标，确定审计重点;同时，加强综合分析，弄清来龙去脉、前因后果、危害影响，努力提高审计结果的质量和水平。
3.突出重点原则。“突出重点”原则是提高工程结算审计业务工作质量的关键。坚持“突出重点”原则，要求在把握全局的基础上抓得住要害，即抓住数额大、危害大、影响大的问题，查深查透，真正发挥审计监督的作用。
4.成本效益原则。“成本效益”原则是当前单位内部审计资源不足情况下提高工程结算审计质量的有效途径。坚持“成本效益”原则，要求在工程结算审计质量控制中，既要强化成本意识，降低费用;又要强化素质，讲求效率;还要搞好工作协调，扬州市审计，合理配置。
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提高审计技术运用水平， 是防范审计风险的技术保证。许多项目都运用计算机进行预算的编制、 数据的管理与计算等，报表审计，
而我们的审计仍然处于手记笔抄的落后阶段。审计技术相对落后， 加上受到审计成本 (包括投入的审计力量、 时间、 费用等)的制约， 手工操作存在着检查的内容不全面、
检查不彻底、 计算结果不精确、 信息提供不及时等缺陷， 这些随时隐藏着审计风险。因此， 防范审计风险必须把提高审计技术水平摆上应有的位置。
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